La iniciativa provino inicialmente de los clubes Universidad Católica, Español de Talca, Universidad de Concepción y Liceo Mixto, quienes en diciembre de 2009 decidieron retirarse del antiguo torneo, aunque no obstante, hubo un período de transición en que los mismos cuatro clubes retornaron a la Liga Dimayor, disconformes con el manejo administrativo de la Liga Nacional por parte de Miguel Herrera, presidente de la Liga Nacional en ese momento. El primer campeonato fue ganado por Español de Talca, club que además posee el récord de campeonatos junto a la Universidad de Concepción, con tres títulos. En esta temporada logró los títulos de Premier League y Copa de la Liga. A finales de la década, el club inicia su segunda época dorada con la llegada del entrenador italiano Claudio Ranieri, del veloz goleador Claudio «Piojo» López y de Gaizka Mendieta, que conquistan la Copa del Rey 1998-1999 y consiguen la primera clasificación del equipo para disputar la moderna Liga de Campeones. Luego de diecisiete años, en la temporada 2023/24 llegó el cuarto título en la Liga Nacional, con Gonzalo Pérez como entrenador debutante, tras vencer por 4-2 en la serie final a Instituto (C) luego de perder los dos primeros partidos.
En la Liga Nacional 2012-13 Español de Talca volvió a coronarse campeón, nuevamente frente a Las Águilas de Boston College, que consiguió su tercer subcampeonato consecutivo, haciendo una campaña casi perfecta con sólo 2 derrotas en todo el campeonato, venciendo por el mismo marcador de la primera final en el tiempo extra del cuarto partido. Los aficionados béticos ocupan el cuarto puesto de la liga en número de asistentes. El equipo que más puntos sume al final del campeonato será proclamado campeón de liga y obtendrá el derecho automático a participar en la fase de grupos de la siguiente edición de la Liga de Campeones de la UEFA, junto con el subcampeón y el tercer clasificado, que a partir de esta temporada obtiene el acceso directo, sin disputar una fase previa como en años anteriores. La temporada inaugural de la Liga Nacional tuvo un recibimiento optimista, siendo partícipes de ésta 12 equipos del país.
Organizada por la Federación de Básquetbol de Chile, su creación se gestó en 2010 como respuesta al descontento con el manejo administrativo y financiero de la Dimayor, la que fue, entre 1979 y 2012, la mayor categoría de básquetbol del país. ↑ Ortelli, Ignacio (4 de diciembre de 2010). «Leo Gutiérrez hizo historia en la Liga Nacional». Finalmente, en 2010 la Liga B fue renombrada como Liga Nacional de Básquetbol, situándose como la principal categoría del certamen, mientras que la Liga C pasó a denominarse Liga Nacional Promocional. Los que finalicen en los primeros 8 puestos clasificarán a play-offs. La temporada constará de 3 fases: La Temporada regular, los Play-offs y las Finales. Luego de eliminar en los play-offs a Sagrados Corazones y a Universidad Católica, Español de Talca llegó a la primera final de la historia donde enfrentó a Boston College (que dejó en el camino a Deportivo Alemán y Liceo Mixto de Los Andes), venciendo por un marcador de 3-1, convirtiéndose en el primer campeón de la Liga Nacional.
Durante la Temporada 2015-16 se coronó campeón Club Deportivo Valdivia, ganando la serie por 4-2 frente a Universidad de Concepción en Valdivia, lo que le permitió a Club Deportivo Valdivia representar al país en la Liga Sudamericana de Clubes. La Temporada 2016-17 trajo consigo una serie de cambios en el formato del torneo, como lo fueron: el paso de 4 meses de competencia a 7 u 8 meses, la creación de las Conferencias Centro y Sur en donde cada equipo jugaría play off por su respectiva conferencia mientras que ambos finalistas nacionales serían los campeones zonales, y la pérdida de la categoría de los equipos que quedarían en el último puesto de la tabla de sus conferencias. Para la temporada actual, se destaca el debut en esta competencia del club Liceo Pablo Neruda de Temuco. La temporada 2003/04 empezó a destacar con el equipo juvenil, anotando 35 goles en la liga de la categoría. Si bien en un comienzo se proyectó la creación de tres división (Liga A, Liga B y Liga C), en los años 2008 y 2009, únicamente se disputaron estas dos últimas. Con la sentencia Bosman de 1995, que abrió las puertas de la Liga a todos los europeos, se redujeron a tres las plazas de extracomunitarios por club.
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