Una nueva temporada de la NBA está en marcha, con 29 equipos que buscan destronar a los campeones Celtics. Aquella temporada además el Iurbentia Bilbao Basket lideró por primera vez la clasificación de la temporada regular tras una gran primera vuelta, que produjo su debut en la Copa del Rey, y su posterior eliminación en semifinales a manos del TAU Baskonia tras eliminar nuevamente al AXA F.C. La temporada 2001-2002 sin embargo supuso un salto de calidad para el conjunto bilbaíno, que tras una profunda renovación de su plantilla y con la contratación del técnico bilbaíno Txus Vidorreta, se propuso el objetivo de ascender a la LEB Oro. Las dos temporadas siguientes sirvieron de refuerzo y asentamiento en la ACB para que la temporada 2007-2008 supusiera el salto de calidad definitivo. La temporada 2002-2003 supuso un salto de calidad importante y tras obtener el subcampeonato de la Copa del Príncipe, disputaron los cuartos de final del Play-off contra el León Caja España resultando eliminados por un ajustado 2-3. Tras reforzarse con fichajes como los de Venson Hamilton o José Luis Maluenda, lograron clasificarse al año siguiente como líderes de la temporada regular para posteriormente alcanzar el ascenso a la ACB y el título de la LEB Oro.
Sus mayores éxitos hasta la fecha han sido el subcampeonato de la Liga ACB en la temporada 2010-11 y de la Eurocup en la 2012-13. El 18 de julio de 2014 fue excluido de la Liga ACB y posteriormente readmitido el 8 de agosto del mismo año. ↑ a b c Harris, Beth (18 de julio de 2013). «ESPY Awards 2013: LeBron James Wins 3 Trophies, Jon Hamm Mocks Dwight Howard In Monologue». Su primer gol oficial con el equipo sería frente a Belgrano de Córdoba el 16 de noviembre de 2013 abriendo el marcador de lo que sería un 4-2 que encaminaría al equipo a la obtención del título. Posteriormente el KAS Vitoria se trasladaría a Bilbao en el año 1968 después del descenso del Águilas, formando el KAS Bilbao, equipo que se mantuvo en la primera división hasta su desaparición en 1974, coincidiendo con el mismo Águilas después de su ascenso en 1969 y protagonizando derbys bilbaínos en la liga nacional durante los siguientes años. La temporada 2009-10 supuso además, la organización de la Copa del Rey en el BEC con la participación del Bizkaia Bilbao Basket como organizador.
Mientras que en la primera vuelta de la competición liguera el equipo mantuvo un nivel discreto perdiéndose la Copa del Rey, los resultados en la primera fase de la Euroliga fueron satisfactorios clasificándose para el Top 16, derrotando a equipos como el Olympiacos en la jornada inaugural, el Fenerbahçe Ülker, el SLUC Nancy y como colofón apartando de la competición en la última jornada, al Caja Laboral Baskonia. En el verano de 2010 fue precisamente una decisión del entrenador griego una de las más polémicas en la historia del club, al decidir prescindir de Javi Salgado, hasta entonces capitán del equipo. En enero de 2010, después de tener un mal comienzo de temporada (4 victorias y 13 derrotas), Txus Vidorreta ofreció al club su dimisión después de 9 temporadas al frente del equipo. Fue sustituido por el griego Fotis Katsikaris, el cual consiguió enderezar la trayectoria del equipo con 8 victorias consecutivas, quedándose a una sola victoria de la 8.ª plaza, para poder jugar los play-offs.
Al canjear a Karl-Anthony Towns antes del inicio de la temporada, los Wolves son oficialmente el equipo de Edwards. Aunque el equipo se dio la vuelta en su siguiente partido para vencer a Letonia 102-91, detrás de los grandes juegos del pívot Alexis Ajinça (25 puntos y 3 tapones) y de Tony Parker (23 puntos). El ascenso además de producir una ampliación del apoyo institucional, supuso también la entrada de Lagun Aro como nuevo patrocinador, gorra nba chicago bulls a la postre necesario para financiar el acceso a la ACB. Posteriormente, lograría cerrar la temporada regular no sin demasiados apuros en una meritoria 6.ª plaza, repitiendo la mejor clasificación de su historia, preparados para encarar el play-off contra el Power Electronics Valencia de Svetislav Pešić, que se mostraba como uno de los aspirantes al título de liga. No obstante, en Valencia logran su primera victoria en el play-off de su historia, para cerrar su pase a semifinales con un 2-0 en Bilbao. No obstante, la Asociación de Baloncesto de la República Popular China negó haberse puesto en contacto con el jugador.